Latest Entries »

 

MRSA Cells With and Without Nanoparticles MRSA bacteria before, left, and after, right, incubation with a new biodegradable polymer nanoparticle. Cell destruction is clearly visible. The bottom two images are magnified with respect to the top images. Nature Chemistry/Courtesy IBM

A new breed of biodegradable nanoparticles can glom on to drug-resistant bacteria, breaching their cell walls and leaking out their contents, selectively killing them. The polymer particles could someday be used in anything from injectable treatments for drug-resistant bacteria, to new antibacterial soaps and deodorants, according to inventors at IBM. After their work is done, the particles break apart, flushing away with the invaders they destroyed.

The nanoparticles, which IBM says are relatively inexpensive, were effective against bugs that have been evolving to resist antibiotics, including methicillin-resistant Staphylococcus aureus(MRSA). Preliminary results suggest the particles could also be effective against yeast, fungus and small bacteria like E. coli, IBM says. Research on the new particles is reported in this week’s issue of the journal Nature Chemistry.

 

Antibiotics kill microorganisms in various ways, including interfering with their DNA or interacting with their ability to rebuild their cell walls, explains James Hedrick, advanced organic materials scientist and master inventor at IBM Almaden Research Center in San Jose, Calif. But some of the bugs survive the onslaught, leading to new generations of bacteria that won’t succumb to the drugs.

 

A new class of positively charged plastic micro-machines, including IBM’s nanoparticles, take a somewhat more physical approach.

“These are designed to slice the cell membrane, to rip the membrane up and eliminate the contents,” Hedrick said. “It’s kind of like the way a virus would work — a virus drills a pore, empties the contents and hijacks it. This is drilling in little holes, and all the contents leak out.”

Transmission electron micrographs show it works: As the images show, the cell walls have been ruptured and everything inside is gone. The best part is that bacteria cannot evolve resistance because it’s a physical attack, not a chemical one.

 

Before and After: On the left, a healthy Enterococcus faecalis bacteria cell; on the right, a destroyed cell, with a ruptured wall and leaky contents clearly visible. Enterobacteria like this one — and like salmonella and e. coli — are found in the intestinal tract.  Nature Chemistry/Courtesy IBM

 

These particles are special because they self-assemble in water and are biodegradable, unlike other nanoparticle treatments. They’re made of amphiphilic polycarbonate material, meaning some of the particles are water-loving and some are water-phobic. When exposed to fluids — like serum or blood — the polycarbonate self-assembles into clumps about 200 nanometers in size. Another part of the clump is positively charged, designed to match the negatively charged surface of microbes, Hedrick said.

Cell walls are dynamic barriers, constantly morphing and changing as they divide. When something binds to their surface, the walls’ synthesis is interrupted. Penicillin, for instance, binds to an enzyme that helps build the walls. Hedrick and collaborators at the Institute of Bioengineering and Nanotechnology in Singapore say the charged particles interact with the cell walls to destabilize them.

“These particles are cationic (positively charged), so they are attracted to the microbial membrane surface, and it begins to disrupt that dynamic assembly process of the membrane,” Hedrick said.

The authors also report that the particles can be used at relatively low concentrations. Hedrick said they’re not sure what makes the particles so effective, but it’s probably because they can each kill multiple cells, moving on to new targets after the membranes are so disfigured that static no longer binds the cells and nanoparticles together.

“A little of the polymer goes a long way,” Hedrick said.

After a few days of this, enzymes start breaking apart the chains that hold the particles together, said Bob Allen, senior manager at IBM-Almaden’s Advanced Materials Chemistry department.

“Think of the enzyme as a pair of scissors — it will go through and snip it. It’s just a weak link that allows you to have a degradable system,” he said.

The particles degrade to molecules of alcohol and carbon dioxide, which are removed just like anything else in the bloodstream.

IBM believes the particles could be a new way to treat drug-resistant bacteria, especially MRSA, which is frequently associated with hospital infections. The company says antibiotic-resistant bacteria is a fertile field for its polymer research labs — chemists do focus primarily on electronics, but chip-scale research translates well to research in health care, water purification, and energy, Allen said.

Hedrick and Allen cautioned that they’re not clinicians and they don’t know how the particles would be used. But they were optimistic about the possibilities.

“The applications are going to be very diverse, whether we’re talking about wound healing or dressing, skin infection, and quite possibly injections into the bloodstream,” Hedrick said. “But this is way early in the discovery process to be going there.”

Advertisements

Communicating Nanoparticles A first wave of nanoparticles stimulates injury to tiny blood vessels near the site of a tumor, triggering the body’s natural blood-clotting response. A second wave uses the blood clotting proteins as a beacon, locating a tumor more easily. When they arrive, they release chemotherapy drugs. Gary Carlson/via MIT
On any battlefield, communication is key — troops must be able to communicate their own locations and that of their target, so everyone knows exactly where to bring the fight. MIT researchers are bringing this strategy to the war on cancer, training swarms of cancer-fighting nanoparticles to communicate to do their jobs more effectively.

Specifically, researchers have developed nanoparticles that can guide each other to a destination, resulting in a much more effective onslaught against a tumor.

Nanoparticles could be a boon for cancer treatment because they can travel through the body unimpeded, delivering drugs directly into tumors and lessening the side effects of chemotherapy. But they quickly disperse when they’re released into the body — even in the best cases, only about 1 percent of them reach their intended target, according to MIT.

To improve this outcome, researchers from MIT, the Sanford-Burnham Medical Research Institute and the University of California-San Diego designed nanoparticles that can work in teams. One wave of nanoparticles homes in on a tumor, and when they arrive, they can communicate their location to the other nanoparticles still circulating in the body, helping them find the tumor too.

 

To do this, the nanoparticles take advantage of the body’s blood coagulation process, according to formal MIT doctoral student Geoffrey von Maltzahn, who is the lead author on a paper in Nature Materials describing this new work. At the site of an injury, blood clotting factors and other proteins interact in a chain of steps to form fibrin, which seals the wound and prevents further blood loss, as an MIT news release explains. The proteins not only bind to the area of an injury, but recruit other proteins to the area, von Maltzahn said.

“We’re trying to emulate that on the scale of synthetic particles, such that when one particle gets to the site of disease, it can communicate that event to expedite the subsequent arrival of other synthetic nanoparticles,” he explains in a video posted by MIT’s David H. Koch Institute for Integrative Cancer Research. (Watch it below.)

The researchers used two types of nanoparticles, which could either signal a message or receive it. The signaling particles flow through the bloodstream and arrive at the tumor site, where they trick the body into believing an injury has occurred (either by emitting heat or binding to certain proteins). This stimulates the natural fibrin-building process. Then the receiving nanoparticles, which carry a payload of cancer drugs, are outfitted with proteins that bind to fibrin. The fibrin acts as a homing beacon, helping the nanoparticles travel to the tumor site. They release the drugs once they get there, delivering a targeted blow to the cancer cells.

The researchers studied this method using mice and found that the communicating nanoparticles delivered 40 times more doxorubicin, a common chemotherapeutic, than a system that could not communicate.

MIT researchers are exploring how to test this system with existing clinical studies using nanoparticles.

 

Carrots A 600-calorie daily diet of non-starchy vegetables like carrots reversed type 2 diabetes in a new study. Ed Yourdon via Flickr

Patients who consumed only 600 calories a day for two months were able to reverse their Type 2 diabetes, according to a groundbreaking British study. The research, involving just 11 patients, suggests a very low-calorie diet can remove fat that clogs the pancreas, allowing normal insulin secretion to be restored, according to Newcastle University.

Seven of the 11 patients remained free of diabetes three months after the study, researchers said.

Type 2 diabetes, also known as adult-onset diabetes, has been thought to be a progressive, irreversible condition. Once diagnosed, some patients can control their diabetes with tablets, but many eventually require insulin injections.

 

Type 2 diabetes occurs when the pancreas is unable to produce sufficient insulin to regulate fat metabolism and sugars in the blood, or when the body is unable to react to the insulin. It’s different than Type 1, or juvenile diabetes, an autoimmune disorder in which the immune system destroys the beta cells that produce insulin. 

The study was announced Friday at an American Diabetes Association conference, according to Newcastle University. It is being published in the journal Diabetologia.

The study enrolled 11 patients who had developed Type 2 diabetes later in life, and restricted them to a super-low-calorie diet consisting of diet drinks and non-starchy vegetables. Over eight weeks, researchers monitored the fat content in the liver and the insulin production from the pancreas, comparing the results to a control group of non-diabetics.

After just one week, the diabetics’ pre-breakfast blood sugar levels were normal, according to the researchers. MRI scans of the patients’ pancreases revealed that fat levels had dropped, which allowed the organ to produce more insulin, the researchers said.

“To have people free of diabetes after years with the condition is remarkable – and all because of an eight week diet,” said Roy Taylor, a professor at Newcastle University who led the study and is director of the Newcastle Magnetic Resonance Centre. “We believe this shows that Type 2 diabetes is all about energy balance in the body.”

While the results are promising, researchers caution that diabetic patients should not undertake such a drastic dietary change without medical supervision. One patient, 67-year-old Gordon Parmley, ate salad and vegetables and three diet shakes per day.

“At first the hunger was quite severe and I had to distract myself with something else – walking the dog, playing golf – or doing anything to occupy myself and take my mind off food,” he said in a statement. “But I lost an astounding amount of weight in a short space of time … after six years, I no longer needed my diabetes tablets.”

Scientists at Diabetes UK said the trial was very small, but they looked forward to future results, especially those that would show whether the diabetes reversal held true in the long term.

KOMPAS.com – Salah satu dampak positif pemanasan global adalah meningkatkan kapasitas pohon dan tumbuh-tumbuhan dalam penampungan karbondioksida. Sebuah studi yang dipimipin oleh Jerry Melillo dari Marine Biological Laboratory Amerika Serikat mengindikasikan itu.

Pada ringkasan tulisan penelitian yang dimuat dalam publikasi jurnal Proceedings of the National Academy of Sciences baru-baru ini, dikatakan bahwa menghangatnya iklim telah merangsang penangkapan juga penyimpanan karbondioksida pada bagian tanaman dalam jumlah lebih besar. Menurut para peneliti, makin banyaknya karbon yang terserap saat tumbuhan melakukan proses fotosintesis itu disebabkan lebih banyak nitrogen yang memungkinkan untuk dapat dibuat dalam kondisi suhu tanah hangat.

Selama ini, tutur Melillo, pohon-pohon yang ada di Amerika Serikat umumnya sangat terbatas kandungan nitrogennya. “Kami menemukan bahwa pemanasan (global) telah memerangkap senyawa nitrogen di dalam tanah berupa nitrogen organik, untuk dilepaskan sebagai senyawa anorganik. Ketika pohon menyerap nitrogen anorganik ini, pertumbuhannya akan lebih cepat dan menampung lebih banyak karbon,” jelasnya.

Ia menambahkan, keseimbangkan jumlah karbon di ekosistem hutan untuk dekade-dekade selanjutnya di saat fenomena perubahan iklim juga terjadi, akan sangat bergantung pada aneka faktor lain. “Misalnya, ketersediaan air, efek peningkatan temperatur bagi fotosintesis dan respirasi, serta konsentrasi karbondioksida di lapisan atmosfer,” katanya. (National Geographic Indonesia/Gloria Samantha)

 

KOMPAS.com — Racun pada lebah ternyata bisa digunakan untuk mendeteksi bom. Penggunaan teknologi dengan teknik ini segera dipatenkan.

Peneliti dari Massachusetts Institute of Technology (MIT) menemukan ada fragmen protein dalam racun lebah, yang disebut bombitin, dapat mendeteksi bahan peledak, seperti TNT. Pada saat percobaan tim MIT melapisi bagian dalam tabung karbon dengan bombitin. Kemudian, tabung itu diletakkan di sekitar sampel udara yang diambil dari sekitar berbagai bahan peledak.

Tim mendapati perubahan panjang gelombang pendaran cahaya tabung berubah ketika molekul nitroaromatik dari bahan peledak bersatu dengan protein dari lebah. Perubahan ini tak kasat mata, tapi dapat dideteksi dengan mikroskop khusus.

Tim MIT bukan hanya dapat mendeteksi adanya bahan peledak, melainkan mereka juga dapat membedakan tipe-tipe bahan peledak dengan menggunakan kombinasi tabung karbon dengan berbagai bombitin.

Pendeteksi bahan peledak yang saat ini dipakai di bandara mampu menganalisis partikel di udara. Tetapi, sensor belum dapat mendeteksi pada level molekul. Ketika dipadankan dengan sensor yang sudah ada di bandara, bombitin akan meningkatkan sensitivitas sensor yang membuatnya lebih efektif.

Beberapa perusahaan komersial serta militer sudah menyatakan tertarik dengan temuan ini. Teknologinya sendiri saat ini sedang dalam proses untuk mendapatkan paten. (National Geographic Indonesia/Alex Pangestu)

 

 

KOMPAS.com – Tim ilmuwan yang dipimpin Wei Xiang Jiang dan Tie Jun Cui dari Southeast University, Nanjing, China, baru-baru ini memublikasikan alat yang bisa menyusutkan benda padat hasil studi mereka. Inovasi tersebut diterbitkan dalam edisi terbaru jurnal ilmiah Applied Physics Letters.

Namun, bukan menyusutkan secara fisik. “Alat ini dapat menyusutkan benda secara virtual,” kata Cui. Perangkat yang bekerja pada frekuensi gelombang mikro ini dapat mengelabui radar maupun alat pendeteksi elektromagnetik lainnya sehingga menjadikannya berpotensi untuk diaplikasikan oleh pihak militer.

Para ilmuwan membuat alat penyusut menggunakan metamaterial yang juga digunakan dalam pengembangan jubah tembus pandang. Pada alat ini, metamaterial digunakan untuk membuat delapan cincin konsentris masing-masing setinggi 12 milimeter. Kemudian mereka meletakkan sebuah benda, misalnya sendok, di tengah cincin tersebut.

Saat gelombang cahaya menyebar melalui alat penyusut, gelombang depan melengkung dan panjang gelombangnya dikompresi. Ketika cahaya mencapai bagian tengah lingkaran, panjang gelombang terdekompresi sehingga bagi orang yang melihat dari sisi luar alat penyusut, cahaya yang termanipulasi menciptakan ilusi benda dengan bentuk yang sama dengan benda sesungguhnya, hanya saja berukuran lebih kecil.

“Alat ini dirancang menggunakan transformasi optik yang membuat benda di ruang nyata dan ruang maya tampak sama,” jelas Cui. Pada alat rancangan mereka, benda nyata adalah benda yang berukuran besar sedangkan benda virtual berukuran lebih kecil.

Para ilmuwan itu juga menjelaskan, karena proporsi beberapa benda bergantung pada ukurannya, maka alat penyusut buatan mereka ini dapat menampilkan benda virtual berukuran kecil yang dalam kenyataannya tidak ada.

Selain itu, metode yang digunakan untuk mengembangkan alat penyusut ini juga dapat dikembangkan lebih lanjut untuk merancang dan mewujudkan perangkat ilusi lainnya yang dapat dapat mengubah beberapa parameter lain dari sebuah benda. (National Geographic Indonesia/Agung Dwi Cahyadi)

KOMPAS.com – Asam Deoksirobonukleat (DNA) tak cuma menyimpan kode rahasia makhluk hidup. Lulu Qian dan Erik Winfree, ilmuwan dari California Institute of Technology di Pasadena, AS menggunakan DNA untuk merancang kalkulator DNA yang juga sering disebut kalkulator molekuler atau komputer DNA.

Ada 130 untai DNA yang digunakan untuk menggantikan chip silikon. DNA berfungsi sebagai logic gatesyang memproses sinyal yang masuk dengan hukum sederhana. Sinyal yang masuk dan keluar pun terbuat dari DNA, bukan pulsa elektrik.

Kalkulator DNA yang dibuat Qian dan Winfrey merupakan perbaikan dari sistem komputer DNA yang telah dikembangkan sejak 1990. Kalkulator DNA ini 5 kali lebih kuat dibandingkan sebelumnya, memakai sistem yang lebih fleksibel, sehingga berprospek untuk dikembangkan lanjut di masa depan.

Qian dan Winfrey mengembangkan kalkulator untuk menghitung akar kuadrat bilangan hingga 15 dan membulatkan hasilnya ke bilangan bulat terdekat. Proses penghitungannya cukup rumit, melibatkan kode bilangan biner dan sistem komunikasi kimia sehingga bisa menampilkan hasilnya.

Memakai kalkulator DNA untuk menghitung akar kuadrat cuma demo kemampuan. Muaranya, menurut Winfree, “Jika anda meminta sistem kimia untuk mengerjakan hal asing seperti menghitung akar kuadrat 4 digit bilangan biner, maka Anda mungkin bisa menggunakannya untuk hal lain.”

Andrew Ellington, pakar biokimia dari University of Texas telah berpikir bagaimana cara mengaplikasikan kalkulator atau komputer DNA yang dikembangkan Qian dan Winfree untuk mendiagnosa malaria. “Kita bisa melihat cara yang dipakai Qian dan Winfree, lalu mendesainnya,” katanya.

Tapi, Martyn Amos, pakar komputasi DNA dari Manchester Metropolitan University mengatakan, sistem ini masih terbatas sebab bahkan membutuhkan 10 jam untuk menghitung akar kuadrat. “Tantangan terbesar adalah mengaplikasikan konstruksi ini untuk bekerja di sel hidup,” tambah Amos.

KOMPAS.com — Dalam pengamatan gerhana bulan total yang berlangsung pada Kamis (16/6/2011) dini hari, astronom amatir dari Kebumen, Ma’rufin Sudibyo, berhasil menjepret citra Bimasakti di tengah bulan yang memerah atau mengalami gerhana bulan total.

“Saya lihat Bimasakti saat gerhana. Meski langit sudah terpolusi cahaya, tapi tahapannya masih rendah, jadi bisa terlihat,” katanya saat dihubungi Kompas.com lewat jejaring sosial hari ini.

Ia menambahkan, Bimasakti tampak persis di samping bulan, tepatnya di sebelah timur atau samping kiri. “Tampak seperti awan putih tipis yang berarah utara selatan. Sangat tipis,” terangnya lagi.

Dalam pengamatannya dari Gombong, Kebumen, Jawa Tengah, ia juga berhasil menangkap citra obyek angkasa lainnya. Misalnya, planet Venus dan Jupiter yang tampak pada tahapan akhir gerhana.

Pengamatan di Gombong dipusatkan di RS PKU Muhammadyah wilayah itu. Ma’rufin mengatakan, sekitar 50 orang terlibat dalam pengamatan tersebut. Awan sesekali mengganggu pengamatan dengan melintas cepat.

Ma’rufin juga menangkap citra meteor saat gerhana. “Ada dua meteor. Satu pas sebelum total dan satu lagi pas total. Meteor sporadic. Sepertinya dari debu pecahan asteroid,” kata Ma’rufin.

Beberapa obyek langit yang disaksikan Ma’rufin juga terlihat dari pengamatan di Planetarium Jakarta. Meski berawan, menjelang pukul 05.00 WIB tadi, Jupiter menampakkan diri dalam warna putih di arah timur.

Gerhana bulan total dini hari tadi merupakan salah satu gerhana yang periode totalnya terpanjang dalam 100 tahun terakhir karena mencapai 100 menit. Masyarakat Indonesia masih mempunyai kesempatan menyaksikan gerhana bulan pada Desember tahun ini, diperkirakan terjadi dari sore hingga malam hari.

XML adalah pendekatan utama menyediakan semantik untuk ilmu pengetahuan, seperti MathML , SBML / BIOPAX (biologi), GML dan KML(geo) SVG (grafis) dan NLM-DTD , ODT dan OOXML (dokumen). CML menyediakan dukungan untuk sebagian besar bidang kimia, terutama molekul, senyawa, reaksi, spektrum, kristal dan kimia komputasi (compchem).

CML telah dikembangkan oleh Peter Murray-Rust dan Henry Rzepa sejak tahun 1995 dan merupakan de facto XML untuk kimia diterima oleh penerbit dan memiliki lebih dari 1 juta baris kode Open Source mendukungnya. CML dapat divalidasi dan dibangun menjadi alat authoring (misalnya Kimia Add-in untuk Microsoft Word ).

Peter Murray-Rust dan Henry Rzepa

Infrastruktur mencakup konverter warisan, kamus, Semantic Web dan Data Terbuka Linked.

Ada beberapa versi dari skema CML. Rilis stabil terakhir adalah Skema 2,4 dan tetap tidak berubah sejak tahun 2005.

Skema terbaru adalah 3 versi beta . Seperti yang ditunjukkan oleh beta skema ini masih dalam pengembangan tapi pada dasarnya itu terdiri dari 2,4 Skema asli tetapi dengan model konten jauh berkurang. Hal ini memungkinkan pengguna untuk menempatkan bersama-sama elemen dan atribut dengan cara yang lebih fleksibel agar sesuai dengan data yang mereka ingin mewakili lebih mudah.

pada bagian tutorial :

1.Konvensi Molekuler

Konvensi molekuler digunakan untuk menentukan kimia yang berkaitan dengan molekul, misalnya koneksi tabel rumus, nama dan sifat. Molekul-molekul dapat juga mengandung spektrum meskipun ini akan memiliki konvensi sendiri tergantung pada apakah mereka Infra Red, NMR dll

Namespaces

Hal ini diasumsikan bahwa ruang nama berikut ini terikat pada prefiks berikut:

Menentukan konvensi

Untuk menggunakan konvensi molekul yang Anda butuhkan untuk menggunakan convention atribut. Hal ini dapat dilakukan di kedua cml unsur atau molecule unsur. Sebagai contoh:

 <cml:cml convention='conventions:molecular'>
	 ...
 </ CML: CML>

atau

 <cml:molecule convention='conventions:molecular' id='m1'>
	 ...
 </ CML: molekul>

Sebuah meja molekul koneksi

Koneksi tabel terdiri dari atom dan ikatan antara mereka. Untuk menentukan atom hidrogen di CML xml berikut digunakan:

 <cml:atomArray>
	 <cml:atom id='a1' elementType='H' />
 </ CML: atomArray>

2. Kimia Markup Language – Kamus Konvensi

8 April 2011

Versi ini :
http://www.xml-cml.org/convention/dictionary-20110525
Versi terbaru:
http://www.xml-cml.org/convention/dictionary
Sebelumnya versi:
http://www.xml-cml.org/convention/dictionary-20110408
Penulis:
Lihat pengakuan .
Editor:
Sam Adams, Universitas Cambridge
Joe Townsend, Universitas Cambridge

Abstrak

Spesifikasi ini mendefinisikan persyaratan dari Bahasa Markup Kimia kamus konvensi.


Daftar isi

1. Pendahuluan
1.1 Notasi Konvensi
1.2 Namespace
2. Menerapkan konvensi kamus
3. Kamus Elemen
3.1 Namespace
3.2 Awalan
3.3 Judul
3.4 Deskripsi
3,5 Entri
4. Elemen Entry
4.1 Id
4.2 Jangka
4.3 Definisi
4.4 Deskripsi
4.5 Jenis data
4.6 Jenis Satuan
4,7 Default unit
5. Contoh Kamus

Lampiran

A. Referensi
B. Ucapan Terima Kasih


1. Pendahuluan

Kamus memungkinkan CML untuk dipahami oleh mesin. Banyak ilmu fisik dikelola melalui mekanisme kamus. Kami menemukan istilah dan unit yang berkaitan dengan aspek ilmu pengetahuan (seperti panas pembentukan, titik lebur, grup jalur) dan membuat entri untuk item ini dalam kamus.

Entri dapat terdiri dari hanya sebuah id unik (dalam namespace kamus) dan beberapa definisi manusia dimengerti namun kami sangat mendorong informasi lebih lanjut diberikan. Misalnya apa unit, ada atas dan batas bawah, apa jenis data (string, integer, dll float).

Program yang berbeda kadang-kadang menghasilkan data dengan label yang sama tetapi interpretasi yang berbeda; tidak berarti kepadatan kerapatan elektron atau kepadatan fisik? Oleh karena itu masing-masing kode kimia komputasi akan memiliki kamus sendiri dan kemudian masyarakat kemudian dapat memutuskan untuk grup tertentu konsep bersama.

Mana konsep ini didefinisikan oleh skema CML mereka TIDAK BOLEH ditentukan dengan menggunakan mekanisme kamus.

Dimana konsep-konsep yang didefinisikan oleh kamus baku entri-entri ini HARUS direferensikan, bukan mendefinisikan konsep dalam kamus lain.

1.1 Notasi Konvensi

Kata kunci “HARUS”, “TIDAK HARUS”, “REQUIRED”, “AKAN”, “TIDAK AKAN”, “HARUS”, “TIDAK HARUS”, “RECOMMENDED”, “MUNGKIN”, dan “OPTIONAL” dalam dokumen ini adalah untuk ditafsirkan seperti yang dijelaskan dalam RFC 2119 [ IETF RFC 2119 ].

Istilah “elemen”, “atribut”, “anak” dan “orang tua” dalam dokumen ini adalah untuk ditafsirkan seperti yang dijelaskan di Rekomendasi W3C Extensible Markup Language (XML) [ W3C XML ].

Penggunaan font adalah sebagai berikut:

  • Skema istilah, termasuk elemen dan atribut, ditulis dalam this font .

1.2 Namespace

Spesifikasi ini menggunakan ruang nama berikut dan prefiks untuk menunjukkan mereka ruang nama:

Awalan Namespace URI Keterangan
cml http://www.xml-cml.org/schema Kimia unsur Markup Language
convention http://www.xml-cml.org/convention/ Standar Kimia Markup Language konvensi namespace
xhtml http://www.w3.org/1999/xhtml XHTML

2. Menerapkan konvensi kamus

Konvensi Kamus HARUS ditentukan dengan menggunakan convention atribut pada baik cml atau dictionary elemen. Jika konvensi ditetapkan pada cmlmaka elemen elemen yang HARUS mengandung elemen anak tunggal dalamhttp://www.xml-cml.org/schema namespace, yang HARUS dictionary elemen.

3. Kamus Elemen

3.1 Namespace

Para dictionary elemen HARUS memiliki namespace atribut, nilai yang HARUS URI yang valid mendefinisikan ruang lingkup di mana ketentuan entri yang unik. URI namespace kamus HARUS memutuskan untuk representasi dari kamus. URI namespace kamus HARUS berakhir dengan baik karakter ‘/’ atau karakter ‘#’ sehingga istilah dapat direferensikan oleh menambahkan mereka ke URI.

3.2 Awalan

Para dictionary elemen HARUS memiliki dictionaryPrefix atribut menetapkan prefiks standar yang digunakan ketika referensi entri kamus. ParadictionaryPrefix HARUS prefiks QName XML yang valid, dan HARUS menjadi unik dalam domain CML.

3.3 Judul

Para dictionary elemen HARUS memiliki title atribut ditujukan untuk manusia-dibaca.

3.4 Deskripsi

Para dictionary elemen HARUS memiliki satu description elemen anak, yang isinya memberikan gambaran terbaca-manusia dari domain kamus. Paradescription Unsur HARUS berisi elemen anak satu atau lebih dihttp://www.w3.org/1999/xhtml namespace. Para description Unsur TIDAK HARUS berisi elemen anak apapun tidak di http://www.w3.org/1999/xhtmlnamespace.

3,5 Entri

Para dictionary Unsur HARUS berisi satu anak bijih lebih entry elemen, dan tidak HARUS mengandung elemen anak lainnya dari http://www.xml-cml.org/schema namespace.

4. Elemen Entry

4.1 ID

Sebuah entry elemen HARUS memiliki id atribut, nilai yang HARUS unik dalam lingkup kamus.

Nilai id atribut HARUS dimulai dengan huruf, dan hanya HARUS berisi huruf, angka, titik, tanda hubung atau garis bawah.

IdStartChar :: = [AZ] | [az]
IdChar :: = IdStartChar | [0-9] | "." | "-" | "_"
Id :: = IdStartChar (IdChar)*

4.2 Jangka

Sebuah entry elemen HARUS memiliki term atribut, nilai yang memberikan frase bahasa nounal unik mengidentifikasi subjek entri.

Nilai term atribut MUNGKIN mengandung karakter unicode yang valid, namun itu adalah bahwa setiap karakter RECOMMENDED dari luar subset ASCII (codepoints 32-127) diwakili menggunakan referensi entitas.

4.3 Definisi

Sebuah entry HARUS berisi elemen tunggal definition elemen anak, isi yang memberikan frase nounal mendefinisikan subjek masuk lebih verbosely dari istilah.

Para definition Unsur HARUS berisi elemen anak satu atau lebih dihttp://www.w3.org/1999/xhtml namespace. Para definition Unsur TIDAK HARUS berisi elemen anak apapun tidak di http://www.w3.org/1999/xhtmlnamespace.

4.4 Deskripsi

Sebuah entry elemen MUNGKIN memiliki satu description elemen anak, isi yang menyediakan informasi lebih lanjut mengenai istilah, termasuk, namun tidak terbatas pada: contoh, terbaca-manusia semantik dan hyperlink ke sumber daya lain yang bermanfaat.

Para description Unsur HARUS berisi elemen anak satu atau lebih dihttp://www.w3.org/1999/xhtml namespace. Para description Unsur TIDAK HARUS berisi elemen anak apapun tidak di http://www.w3.org/1999/xhtmlnamespace.

4.5 Jenis data

Ketika berlaku untuk konsep didefinisikan, sebuah entry HARUS memilikidataType atribut, nilai yang merupakan QName referensi tipe data nilai didefinisikan dengan menggunakan entry .

Umum tipe data:

  • xsd:string
  • xsd:double
  • xsd:integer
  • xsd:boolean

4.6 Jenis Satuan

Sebuah entry HARUS memiliki unitType atribut, nilai yang merupakan QName referensi jenis unit (misalnya suhu) dari setiap nilai yang didefinisikan menggunakan entry .

Sebuah entry menggambarkan sebuah konsep yang tidak seharusnya unit; misalnya nama program harus memiliki unitType ada di CML standarunitType kamus .

4,7 Default unit

Ketika berlaku untuk konsep didefinisikan, sebuah entry HARUS memilikiunits atribut, nilai dari yang merupakan referensi QName unit default (misalnya Kelvin) dari setiap nilai yang didefinisikan menggunakan entry .

Jika unitType secara tegas diberikan sebagai tidak diketahui maka atribut unit TIDAK HARUS hadir.

Jika unitType secara tegas diberikan sebagai tidak maka atribut unit HARUS hadir dan nilainya harus mengarah ke none # http://www.xml-cml.org/unit/si.

5. Contoh Kamus

 <Xml version = "1.0" encoding = "UTF-8"??>
 <Kamus xmlns = "http://www.xml-cml.org/schema"
             xmlns: konvensi = "http://www.xml-cml.org/convention/"
             xmlns: unit = "http://www.xml-cml.org/unit/nonSi/"
             xmlns: unitType = "http://www.xml-cml.org/unit/unitType/"
             xmlns: xhtml = "http://www.w3.org/1999/xhtml"
             xmlns: xsd = "http://www.w3.org/2001/XMLSchema"
             konvensi = "konvensi: kamus"
             title = "konsep-konsep kimia dasar"
             namespace = "http://www.xml-cml.org/dictionary/dummy/"
             dictionaryPrefix = "dummy">
         <description>
             <xhtml:p>
                 Ini adalah contoh kamus
             </ Xhtml: p>
         </ Description>

     <Entri id = "molecmass" Istilah = "Misa Molekuler"
dataType = "xsd: double" unitType = "unitType: jumlah" unit = "Unit: Dalton">
         <definition>
             <xhtml:p>
Massa satu mol suatu zat dalam satuan massa atom terpadu (Dalton).
             </ Xhtml: p>
         </ Definisi>
         <description>
             <xhtml:p>
Massa molekul (m) zat adalah massa satu molekul zat yang,
dalam satuan massa atom terpadu (s) u (sama dengan 1 / 12 massa satu atom
isotop karbon-12).  Ini adalah numerik setara dengan massa molekul relatif
(Mr) dari molekul, sering disebut dengan istilah berat molekul, yang
merupakan rasio massa molekul yang untuk 1 / 12 massa karbon-12 dan merupakan
berdimensi nomor.  Dengan demikian, adalah keliru untuk mengekspresikan massa
molekul relatif (berat molekul) di dalton (Da).  Sayangnya, berat molekul dan
massa istilah molekuler telah bingung di berbagai situs, yang sering menyatakan
bahwa berat molekul digunakan di masa lalu sebagai istilah lain untuk massa
molekul.
             </ Xhtml: p>
             <xhtml:p>
Massa molekul berbeda dari pengukuran yang lebih umum dari massa bahan kimia,
seperti sebagai massa molar, dengan memperhatikan komposisi isotop molekul yang
agak daripada distribusi isotop molekul rata-rata banyak.  Akibatnya massa,
molekul adalah jumlah lebih tepat daripada massa molar, namun lebih akurat untuk
menggunakan molar massa pada sampel massal.  Ini berarti bahwa massa molar adalah
sesuai sebagian besar waktu kecuali ketika berhadapan dengan molekul tunggal.
             </ Xhtml: p>
         </ Description>
     </ Entry>

     <Entri id = "molarmass" Istilah = "Massa molar"
dataType = "xsd: double" unitType = "unitType: jumlah" unit = "Unit: Dalton">
         <definition>
             <xhtml:p>
                 Massa per jumlah substansi.
             </ Xhtml: p>
         </ Definisi>
         <description>
             <xhtml:p>
Massa molar, simbol M, merupakan karakteristik properti fisik dari zat yang
diberikan (Unsur kimia atau senyawa kimia), yaitu massa per jumlah substansi.
Unit dasar SI untuk massa adalah kilogram dan bahwa untuk jumlah zat adalah
mol.  Dengan demikian, unit diturunkan untuk massa molar adalah kg / mol.
Namun, untuk kedua alasan praktis dan historis, massa molar hampir selalu
dikutip dalam gram per mol (g / mol atau g mol-1), khususnya dalam kimia.
             </ Xhtml: p>
             <xhtml:p>
Massa molar berkaitan erat dengan massa molar relatif (Mr) suatu senyawa,
yang tua berat rumus panjang dan massa atom standar konstituen
elemen.  Namun, harus dibedakan dari massa molekul (juga
dikenal sebagai berat molekul), yang merupakan massa satu molekul (dari
setiap tunggal komposisi isotop) dan tidak langsung berhubungan dengan
massa atom, massa dari satu atom (dari setiap isotop tunggal).  Para dalton,
simbol Da, juga kadang-kadang digunakan sebagai unit massa molar, terutama
dalam biokimia, dengan definisi 1 Da = 1 g / mol, meskipun fakta bahwa itu
adalah ketat unit massa molekul (1 Da = 1,660 538 782 (83) × 10-27 kg).
             </ Xhtml: p>
         </ Description>
     </ Entry>

 </ Kamus>

A. Referensi

[RFC2119]
IETF RFC 2119: Kata kunci untuk digunakan dalam RFC untuk Tunjukkan Tingkat Kebutuhan , S. Bradner, Maret 1997. Tersedia di http://www.ietf.org/rfc/rfc2119.txt.
[XML]
Extensible Markup Language (XML) 1.0 (Edisi Kelima) , T. Bray, J. Paoli, CM Sperberg-McQueen E. Maler dan F. Yergeau, Editor. World Wide Web Consortium. 26 Oktober 2008. Versi ini http://www.w3.org/TR/2008/REC-xml-20081126. versi terbaru dari XML tersedia di http://www.w3.org/TR/REC-xml.

B. Ucapan Terima Kasih

  • Peter Murray-Rust
  • Joe Townsend
  • Nick Inggris
  • Weerapong Phadungsukanan
  • Daniel Lowe
  • Sam Adams
  • Hannah Barjat

Spektrofotometer

Peralatan spektrofotometer dibedakan
menjadi empat, yaitu :
  1. Spektrofotometer single Beam
  2. Spektrofotometer Double Beam
  3. Spektrofotometer Multichannel
  4. Spektrofotometer flourometer
Gambar Spektrofotometer :
1. Spektrofotometer Single Beam
2. Spektrofotometer Double Beam
3. Spectrofotometer Multichanel
4. Spektrofotometer Flourometer